借助"蛋(dan)白冠"及Vorman效應(ying)的作用機製(zhi),使具有更(geng)強結(jie)合親和力的蛋白與早期吸附在納米顆粒表面的蛋白发生竞争性置换,从而能够针對生(sheng)物樣本中的低豐度蛋白進行高效(xiao)富集,有效提高(gao)檢測灵敏度。
MagicOmics DMB試剂盒在多(duo)樣本檢測领域具有廣泛(fan)的適用性,不仅(jin)可以處理(li)血浆血清、脑脊液、尿液、細胞上清液等多種生物樣(yang)本類型(xing),而且兼容人、鼠、兔、羊、牛等不同(tong)物種的樣本檢測需求,满足臨床(chuang)诊
在大規模(mo)人群隊列(lie)中進行系統的基因組和蛋白組分析,通過全基因組關聯分析方法筛選(xuan)與疾病相(xiang)關聯的遗傳關聯蛋白,進一(yi)步深入研究这些候選位點的功能機製與調(diao)控網絡特征,从分子層面探索疾病的发生发展作用機製,並據此挖(wa)掘疾病的潜在
通過建(jian)立发現隊列和驗證(zheng)隊列的雙層筛選機製,系統地甄別與特定疾(ji)病相關的生物標志(zhi)物蛋白質,進而(er)在臨床實践中可應用於疾病的(de)早期
通過對患者发病過(guo)程中血浆蛋白質的動態變化進行深(shen)入分析,以及對患者與對照組間蛋白質(zhi)表達水平的對比研究,系統地尋找並鉴定(ding)差(cha)异表達蛋白,在此基礎上進行相應的(de)功能分
全流程全自(zi)動化樣本前處理結合最新(xin)高分辨質谱儀timsTOF HT進行蛋白(bai)質組學檢(jian)測,助力生物標志物的開拓(tuo)
普通深度(du)、高深度最低仅(jin)需50uL血浆樣本;
最快10個工作日交付結果。
技術成果发(fa)表在《Analytica Chimica Acta》、《質谱學報》。兩篇文章對市面上(shang)多種低豐度蛋白富集(ji)的方法進行了測試,結果(guo)表明DMB試剂盒能够(gou)富集更多的血浆(jiang)、血清(qing)低豐(feng)度蛋白,助力血液蛋白標志物的(de)发現。
血浆蛋(dan)白質組生(sheng)物信息分析:標準分析+血浆特色分析+高級分析
高級分析:
標志物筛選:機(ji)器學習算法筛(shai)選蛋白標志物
PWAS:全蛋白質組關聯分析
多組學聯合分析:蛋白質組(zu)代谢組聯(lian)合分析;蛋白質組轉錄(lu)組聯合分析
在(zai)血浆蛋白質組學研(yan)究中,低豐度蛋白的檢測一直是關键难(nan)點,因為其含量往往被高豐度蛋白掩盖。本方法通過采用自主研发的血浆低豐度(du)蛋白(bai)富集磁珠試剂盒(MagicOmics-DMB)對血(xue)浆樣本中的低豐度蛋白(bai)進行针對性富集,有效消除高豐度蛋白(bai)的干(gan)扰。樣本富集后,利用自主研发(fa)的全流程(cheng)自動化前處理機器人(MagicOmics-AP-96)進(jin)行標準化樣本製備,確保處理過程的(de)一致性(xing)和可重复性。製備完成的樣本随后使用高(gao)通量timsTOF HT質谱儀進行蛋白質(zhi)檢(jian)測分析,该(gai)儀器具有高灵敏度和高分辨率的特點,能够實現血浆蛋白質(zhi)組的超高深(shen)度覆盖。

发表期刊:Analytica Chimica Acta
影響因子:5.7
发表單位:中國人民解放军总医(yi)院(yuan)&青莲百奥(ao)
发表時間:2023.07.04

发表期刊:質谱學報
影響因子:/
发表單位:中(zhong)國計量大(da)學
发表時間:2024.03.19
| 樣本類型 | LFQ/ DIA/PRM | TMT | 内源性多肽 | HILIC糖基化 |
| 血(xue)浆/血清/(不去除(chu)高豐度) | 5μL | 10 μL | 200μL | 10μL |
| 血(xue)浆/血清/(去(qu)除高豐度-伯乐) | 100 μL | 300μL | 500μL | / |
| 血浆/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 50μL | 50μL | 500μL | / |
| 血(xue)浆/血清(去(qu)除高豐度-DMB蛋(dan)白冠) | 50μL | / | / |
500 μL |
基於"蛋(dan)白冠"及"Vorman效應(ying)"的理论基礎,通過對納米磁珠表面進行特殊(shu)的化(hua)學修飾處理,使其對血浆樣品中的中、低豐度蛋白質具有更(geng)高的親和力與結(jie)合能力,从而能够以非特异性的方(fang)式高效去除血浆中的高豐度蛋(dan)白質,有利於后續(xu)的蛋白質檢測與分析
血清:
1)使用真空采血管收集(ji)血液(不(bu)含(han)抗凝剂,紅盖);
2)轻(qing)轻地上(shang)下颠倒混匀 5-6 次;
3)4℃,静置 15-30 min,1100 g 离心 10 min;
4)用移液器將上(shang)層淡黄色血清轉移到离(li)心管中,瞬時离心。
5)液(ye)氮速(su)冻,- 80℃短期保存(cun),干冰寄送。
注:1)樣品製(zhi)備過程中不能溶血。2)血清參考得率:30%~50%(例如:1mL全血大約能(neng)得0.3~0.5mL血清)。
血浆:
血(xue)常規檢查應選用含有EDTA抗凝剂(ji)的采血管(guan)進行血液采集,其采血管盖帽顏色為紫色(se),作為臨床血液學檢驗的標準采集工具。
將(jiang)樣品轻轻地上下颠倒混匀(yun)8-10次,充(chong)分均匀化后,立即置於4℃冷藏環境中(zhong),以1200g离心力進行10分鐘的离(li)心處理,實現
3)用移液器將血(xue)浆轉移到离心管(guan)中,瞬時离心。
4)液(ye)氮速(su)冻,- 80℃短期保存(cun),干冰寄送。
注:1)如(ru)果血浆樣本需要去除(chu)高豐度蛋白,在收集(ji)樣本時不能使用肝(gan)素抗凝剂,只能使用EDTA等其(qi)他抗凝剂。2)血浆參考得率:約50%(例如:1mL 全血大約能(neng)得 0.5mL 血(xue)浆)。
在樣本量(liang)的選擇上,如果臨床(chuang)研究問題定義不(bu)够明確,擴(kuo)大隊列規模通常能提高模型的泛化能力(li)。针(zhen)對(dui)具有明確臨床目的的研究,可采用数十(shi)例的主要樣本配合独立(li)驗證隊列進行評估。