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CHARACTERISTIC

技術特點

  • 檢測通量

一(yi)次(ci)性檢測6-18個樣(yang)本,大隊列樣本需每批加(jia)入1-2個相同樣(yang)本(ben)作為内參;

  • 適用範围

擅长复雜樣本定量(liang)分析,不適用於不同組織(zhi)器官類型樣本混合檢測;

  • 重复性好

所有樣本混合上機,同時(shi)進行(xing)質谱檢測;

  • 缺失值少

為后續生物信(xin)息學分析提供豐富的(de)数據;

  • 注意事項

具(ju)有比(bi)值壓縮效應,蛋白質差异倍数有一定程度壓縮。

APPLICATIONS

應用方向

ADVANTAGES

服務優勢

服務選擇多樣

配備(bei)timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris™ 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多(duo)種質谱分析平(ping)臺,能够满(man)足从基礎科研到應用開发的不同檢測需(xu)求。

提(ti)供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。

項目經驗豐富

  • 項目(mu)經驗涵盖多物種(zhong)、多組織(zhi)器官類型及多疾(ji)病類型,包括:

  • 100+種(zhong)人類(lei)器官、組織、細(xi)胞及疾病類(lei)型;

  • 60+種小鼠器官、組織、細(xi)胞及疾病類(lei)型;

  • 60+種医學、農牧领域模式動物(wu)及非常见動物樣(yang)本;

  • 60+種药物、農牧领域模式植物及非(fei)常见植物樣本(ben);

  • 60+種細菌、真菌等(deng)微生物樣本。


項目文章豐富

與100+所医院、研究所等(deng)單位(wei)建立深度合作;

合作文章(zhang)累(lei)积影響因子300+,发表於多部医學、生物學、植物等领域期(qi)刊(kan)。

  • 服務選擇多樣

  • 項目經驗豐富

  • 項目文章豐富

MEASURED DATA

實測数據

青莲百奥3D定量蛋白質組實測数據

ANALYSIS PROCESS

分析流程

定量蛋白質組生信分析流程

RESULT DISPLAY

結果展示

定量蛋白質組結果展示

CLASSIC CASES

經典案例

经典案例
合作文章|菟丝子與其寄主植(zhi)物之間廣泛的植物(wu)間蛋白質轉移

发表期刊:Molecular Plant
影響因子:17.1
发表單位:中國科學院昆明植物研究所
发表時間:2019.12.05

SAMPLE REQUIREMENTS

樣本要求

樣本類型 送樣量
動物組織 常規組織(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌(ji)肉等(deng)柔软組織) 20 mg
坚硬組織(软骨、毛发) 200 mg
植物組織 柔软組織(木本(ben)植物的叶、花等,草(cao)本植物,藻(zao)類,蕨類植物) 300 mg
坚硬(ying)組織(根、樹皮、樹枝,果(guo)實種(zhong)子等) 3 g
微生物 常见細菌、真(zhen)菌菌體(菌體(ti)沉淀)、精細(xi)胞 50 μL
細胞 悬浮/贴壁培(pei)养細胞(細胞計数/沉淀) 5×106或20 μL
液體類 血浆/血清(不去除高(gao)豐度) 10 μL
血浆/血清(去除高豐度-伯乐) 300 μL
血浆/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14) 50 μL
脑脊液(不去除高豐度) 200 μL
脑脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) 500 μL
卵泡液(不去高豐度) 200 μL
卵泡液(去除高豐度-伯乐)、尿液,精液 2 mL
淋巴液、關(guan)節液(ye)、穿刺液(ye)、腹水 5 mL
唾液/泪液/乳汁 1 mL
培养(yang)基上清(不(bu)能使用含血清的培养(yang)基) 10 mL
FFPE 每片厚度10 μm,面积1.5×2 cm 10-15片
其他 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) 30 μg


FAQ

常见問題

  • TMT的標記定量原理是什麼?

    使用不同的標記試剂對不同的樣本進行標記,使肽段上带上不同的標(biao)簽,但是总質量保持一致,因此不同樣本中的(de)同一肽段的理化性質是一致的,在(zai)液相色谱(pu)分析中能够在同一個保留時間流出,这一特性確保了色谱分离的準確性。在二級質谱分(fen)析(xi)阶段,標記試剂(ji)和(he)肽段間的化學键发生断裂,報告离子峰被質(zhi)谱采集到,報告离子的峰面积即能反映(ying)出某肽段在当前樣本的含量水平(ping)。通過精確測量和比较不同樣本中報告离(li)子(zi)的峰面积差异,就能(neng)够找到某(mou)個肽段在不同樣本中的表達差异,从而實現對(dui)蛋白(bai)質定量分析的目的。

  • TMT蛋白組學分析的優點是什麼?

    通過(guo)應用(yong)特定試剂對來自不同生物學來源的樣品進行分子標記,可以在單次實驗運行中實現(xian)不同樣品間的蛋白質組學(xue)比较分析,並同步完成全部樣品的定性定量檢測(ce)工作。这種(zhong)方法有效降低了(le)實驗過程中的随機误差,避免了不同樣品因儀器因素產生的檢測(ce)偏差(cha),使實驗結果(guo)的重复(fu)性和稳定性顯著提高。

  • 標記定量為何差异倍数會偏小?

    因為TMT試剂特點,樣本實际的差(cha)异倍数會有壓(ya)縮現象。因此差异倍(bei)数一般在1.2,就可以說明差异足够明顯(xian),而LFQ、DIA一(yi)般差异倍(bei)数可達到1.5倍。

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