檢測通量
一(yi)次(ci)性檢測6-18個樣(yang)本,大隊列樣本需每批加(jia)入1-2個相同樣(yang)本(ben)作為内參;
適用範围
擅长复雜樣本定量(liang)分析,不適用於不同組織(zhi)器官類型樣本混合檢測;
重复性好
所有樣本混合上機,同時(shi)進行(xing)質谱檢測;
缺失值少
為后續生物信(xin)息學分析提供豐富的(de)数據;
注意事項
具(ju)有比(bi)值壓縮效應,蛋白質差异倍数有一定程度壓縮。
在臨床大隊列樣(yang)本基礎上開展疾病分型與生物標(biao)志物的系統发現,同步推進生理、病理及感染免疫機(ji)製的(de)深層研究,並贯(guan)穿药物研发全流程的药效評(ping)估與優
围繞(rao)動植物的生长发(fa)育、遗傳育(yu)種及生態保護研究(jiu),深入探討生(sheng)物對環境變化的適應機製與胁迫抗逆特(te)性,同時開展(zhan)營养與饲(si)料成分的系統分析與優化工作,為農業(ye)生產和生
食品營养价值與品質的分析鉴定;產品成分的分析(xi)與優化;食(shi)品安全的提升
配備(bei)timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris™ 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多(duo)種質谱分析平(ping)臺,能够满(man)足从基礎科研到應用開发的不同檢測需(xu)求。
提(ti)供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。
項目(mu)經驗涵盖多物種(zhong)、多組織(zhi)器官類型及多疾(ji)病類型,包括:
100+種(zhong)人類(lei)器官、組織、細(xi)胞及疾病類(lei)型;
60+種小鼠器官、組織、細(xi)胞及疾病類(lei)型;
60+種医學、農牧领域模式動物(wu)及非常见動物樣(yang)本;
60+種药物、農牧领域模式植物及非(fei)常见植物樣本(ben);
60+種細菌、真菌等(deng)微生物樣本。
與100+所医院、研究所等(deng)單位(wei)建立深度合作;
合作文章(zhang)累(lei)积影響因子300+,发表於多部医學、生物學、植物等领域期(qi)刊(kan)。
发表期刊:Molecular Plant
影響因子:17.1
发表單位:中國科學院昆明植物研究所
发表時間:2019.12.05
| 樣本類型 | 送樣量 | |
| 動物組織 | 常規組織(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌(ji)肉等(deng)柔软組織) | 20 mg |
| 坚硬組織(软骨、毛发) | 200 mg | |
| 植物組織 | 柔软組織(木本(ben)植物的叶、花等,草(cao)本植物,藻(zao)類,蕨類植物) | 300 mg |
| 坚硬(ying)組織(根、樹皮、樹枝,果(guo)實種(zhong)子等) | 3 g | |
| 微生物 | 常见細菌、真(zhen)菌菌體(菌體(ti)沉淀)、精細(xi)胞 | 50 μL |
| 細胞 | 悬浮/贴壁培(pei)养細胞(細胞計数/沉淀) | 5×106或20 μL |
| 液體類 | 血浆/血清(不去除高(gao)豐度) | 10 μL |
| 血浆/血清(去除高豐度-伯乐) | 300 μL | |
| 血浆/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 50 μL | |
| 脑脊液(不去除高豐度) | 200 μL | |
| 脑脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 500 μL | |
| 卵泡液(不去高豐度) | 200 μL | |
| 卵泡液(去除高豐度-伯乐)、尿液,精液 | 2 mL | |
| 淋巴液、關(guan)節液(ye)、穿刺液(ye)、腹水 | 5 mL | |
| 唾液/泪液/乳汁 | 1 mL | |
| 培养(yang)基上清(不(bu)能使用含血清的培养(yang)基) | 10 mL | |
| FFPE | 每片厚度10 μm,面积1.5×2 cm | 10-15片 |
| 其他 | 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) | 30 μg |
使用不同的標記試剂對不同的樣本進行標記,使肽段上带上不同的標(biao)簽,但是总質量保持一致,因此不同樣本中的(de)同一肽段的理化性質是一致的,在(zai)液相色谱(pu)分析中能够在同一個保留時間流出,这一特性確保了色谱分离的準確性。在二級質谱分(fen)析(xi)阶段,標記試剂(ji)和(he)肽段間的化學键发生断裂,報告离子峰被質(zhi)谱采集到,報告离子的峰面积即能反映(ying)出某肽段在当前樣本的含量水平(ping)。通過精確測量和比较不同樣本中報告离(li)子(zi)的峰面积差异,就能(neng)够找到某(mou)個肽段在不同樣本中的表達差异,从而實現對(dui)蛋白(bai)質定量分析的目的。
通過(guo)應用(yong)特定試剂對來自不同生物學來源的樣品進行分子標記,可以在單次實驗運行中實現(xian)不同樣品間的蛋白質組學(xue)比较分析,並同步完成全部樣品的定性定量檢測(ce)工作。这種(zhong)方法有效降低了(le)實驗過程中的随機误差,避免了不同樣品因儀器因素產生的檢測(ce)偏差(cha),使實驗結果(guo)的重复(fu)性和稳定性顯著提高。
因為TMT試剂特點,樣本實际的差(cha)异倍数會有壓(ya)縮現象。因此差异倍(bei)数一般在1.2,就可以說明差异足够明顯(xian),而LFQ、DIA一(yi)般差异倍(bei)数可達到1.5倍。