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当蛋白(bai)構象发生變(bian)化時（例如(ru)與小分子結合），會暴(bao)露出不同的(de)廣谱性蛋白酶酶切位點。
一次(ci)酶切后再(zai)將蛋白樣品變性，用胰酶進行二次(ci)酶切。
通過質谱(pu)檢測，比较不同處(chu)理条(tiao)件的樣品中，全酶切及半酶切(qie)肽段（LiP酶切）的(de)信號強度變化，可以分析蛋白構象(xiang)變化。
通過分析差异肽段的情况可以確定小(xiao)分子(zi)與蛋白結合的區域。
通(tong)過生物學和生物化學等多學科交叉手段，发現蛋白質與小分子物質(zhi)（包括(kuo)代谢物、DNA等）之間(jian)的相互作用如(ru)何导致蛋白質分子結構的動態變化，進而深入明確蛋白質和小分(fen)子物質介导的酶(mei)催化、轉錄因子調控、轉運蛋白運輸(shu)等一系列复雜的生(sheng)理調節過程機製，揭示(shi)这些(xie)調控網絡如何协調運作
在(zai)药物研发的(de)關键環節中,通過檢測药物結合靶蛋白所导(dao)致的構象變化可以明(ming)確药物的具體靶點,進而系統解析药物发挥作用的分子機(ji)製,这一過程對於指导疾病的臨
蛋白質的三維結構與其生物(wu)學功能存在(zai)直接關聯，通過對結構(gou)蛋白質組進行全局系統分析，可以判(pan)断結構變化是否反(fan)映了病理生理過程，進而挖
从蛋(dan)白分子的三維構象與空間結構層面(mian)系統解析蛋白在不同生理病理状態下的功能改變機製,通過比较分析肿(zhong)瘤患(huan)者和健康人群蛋白質組在結構特征上的差异表現,深入阐明癌症和各類(lei)疾
根據原始数據，本平臺从結構差异蛋白和豐(feng)度差异蛋白兩個維度深入解析蛋白質組學變化(hua)，同步整合兩類蛋白的聯合(he)分析結果。每個分析模块均包含差异(yi)蛋白的(de)多層次筛選功能、基於基因本體论和通路(lu)数據库的蛋白功(gong)能富集注释、蛋白間相(xiang)互作用網絡的可視化分析。
| 實驗設計 | 豐度變化 | 結構變化 | 聯合分析 | 二維碼圖 | 3D圖 |
| 有胰酶對照（TrP組） | √ | √ | √ | √ | √ |
| 无胰酶對照（TrP組） | × | √ | × | √ | √ |
標準版(ban)服務（同時進行（PK酶+TrP酶）和（TrP酶）酶切）能够提供更全面的信息（豐度+結構），經濟版（只進(jin)行（PK酶+TrP酶）酶切）適(shi)用於更關注蛋(dan)白結構的研究需求（結構）
服務類型 |
服務内容 |
| 標準版 | 1、每個樣本2種酶切方法：1）蛋(dan)白酶K+TrP酶；2）TrP酶 2、每個樣本2次質谱檢測 3、結構肽段的豐度校正 4、差异豐度蛋白分析 5、差异結構蛋白分析 6、差异豐度和結構蛋白聯合分(fen)析(xi) |
| 經濟版 | 1、每個樣本1種酶切方法：蛋(dan)白酶K+TrP酶 2、每個樣本1次質谱檢測 3、差异結構蛋白分析 |
| 内容 | 常規報告 | 药物靶點報告 |
| 豐度信息 | √ | √ |
| 豐度数據 | √ | √ |
| 結構信息 | √ | √ |
| 結構数據 | √ | √ |
豐度分析 |
√ | × |
結構分析 |
√ | √ |
聯合分析 |
√ | × |
数據库注释 |
× | √ |
| 二維碼圖 | √ | √ |
差异肽段的酶切情况 |
× | √ |
3D圖 |
√ | √ |
发表期刊：Nature structural & molecular biology
影響因子：12.5
发表單位：苏黎世聯(lian)邦理(li)工學院
发表時間：2024.07.29
| 樣本類型 | 送樣量要求/樣本 | 運輸 | |
| 動物組織 | 10 mg | 干冰運輸 | |
| 植物組織 | 柔软組織 （木本(ben)植(zhi)物的叶、花等，草本植物，藻類，蕨類植物） |
400 mg | |
坚硬組織 （根、樹皮、樹枝，果實種子等） |
4 g | ||
| 細胞 | 2*106 | ||
| 蛋(dan)白質溶液(ye)（非(fei)變性裂(lie)解液） | 1 μg/μL(不低於200 μL) | ||
| 血清 | 100 μL | ||
| 脑脊液 | 200 μL | ||
•可以(yi)同時分析豐度，對結(jie)構信息進(jin)行补充
•可以(yi)利用豐度信息對結構肽段進行校正，增加数據可信度
