樣品製備是蛋白質組學檢測分析的重要步骤,與質(zhi)谱檢測結果的質量息息相關,通常包括蛋白提取、蛋白酶解(jie)和肽段除盐(yan)三個步骤,根據樣本類(lei)型、研究目的和技術方法的不同,可(ke)以加入蛋白定量(liang)、修飾肽(tai)段富集、稳定同位(wei)素標記、分(fen)級分离等步骤。
通過利用親水性相互作用機製(zhi)來交换或去除那些促進細胞或組(zu)織裂解、蛋白質(zhi)溶(rong)解和酶解的各類組分,包(bao)括洗(xi)涤剂、缓冲液(ye)等物質,从而(er)實現對微量蛋白質組學樣(yang)品的快速製備,满足后(hou)續質谱(pu)分析、蛋白質鉴定等下游應用的樣品需求(qiu)
在(zai)多(duo)種生物樣本類型的微量蛋白質組學測試中,研究團隊分(fen)別采用了20μL尿液(ye)、50ng的293T蛋白(bai)質、500個293T細胞、FFPE石蜡(la)包埋(mai)樣本、100μg脑組織樣本等不同來(lai)源的樣品材(cai)料,結合MMB試剂盒的高灵(ling)敏度檢測能力(li),通過Magicomics-AP-96蛋白質(zhi)組學自動化機器人進行了系統的微量蛋白質組學測試工作,在蛋
01在蛋白質樣品製備(bei)環節中(zhong),采用(yong)MMB試剂盒對5μg的293T細胞蛋白(bai)進行酶切處(chu)理,随后將酶切后获得(de)的肽段利用nanodrop分光光度計進行精確(que)定(ding)量分析,以(yi)此計算肽段的回收率指(zhi)標,實驗結果顯示整體(ti)肽段的回收率
02
在(zai)蛋白(bai)質分离純化實驗中,M代表(biao)分子量標記物(wu),P為含有10μg蛋白質的細胞(bao)裂解液樣品。S是MMB磁(ci)珠與細胞裂解液混合(he)孵育后所得的上清液,代(dai)表未被磁珠吸(xi)附的游离成分。E1和E2分別為第1次和第2次清(qing)洗MMB磁(ci)珠所采用的缓(huan)冲液,用於去(qu)除磁珠表面的非特异(yi)性吸附物質。F為最終的蛋白質回收溶液,用於將磁(ci)珠上結合的目的蛋白洗脱下來(lai)。
01采用(yong)MMB試剂盒對5μg的293T細胞樣品進行酶(mei)切處理,随后通過nanodrop分光光度計對酶切產生的肽段進行精(jing)確定量(liang)分析,據此計算肽段(duan)的回收效率(lv)。
02
打破蛋白(bai)質組(zu)學樣品量極限
独特納米磁珠技術(shu)降低批(pi)次間結果差异
傳統20小時完成的實驗壓縮至(zhi) 2~4 小時
肽段回收率高於80%