
一臺高配電脑
配置操作環境
安裝分析软件
下载專業数據库
然后......
努力(li)做只萬能的程序猿(yuan),寫得了代(dai)碼,改得起BUG,忍得住黑(hei)白屏。
您能欣(xin)然接受並勝任这樣的(de)生活吗?
如果不(bu),那就毫不猶豫的吃下(xia)这顆安利吧。
这可是生(sheng)信分析界的惊天(tian)秘密,一般人我不告(gao)訴他!!!

青莲百(bai)奥(ao)BioLadder生信分析云平臺见刊iMeta(IF=23.7)
駕着七彩祥云而來
带着(zhe)生信分析不求人的使命(ming)
與(yu)您攜手開启轻松加愉快的生信分析之(zhi)旅
下面就和小青莲一起看看这份发表(biao)在顶刊的“生信寶(bao)典”
助力您實現“分析(xi)自由”的灵魂
BioLadder是北京(jing)青莲百奥生物科技有限公司在蛋白(bai)質組學领域推出的自主研发在線数據分析平臺,面向高通(tong)量質谱檢測、生物医(yi)药研发、臨床轉化等多個應用場景設計(ji)。平臺内置(zhi)3類實驗(yan)数據分析模块和4類常(chang)規数據分析模块,覆盖蛋白(bai)鉴定(ding)、定量分(fen)析(xi)、修飾位(wei)點发現等蛋(dan)白質組學工作流的關键環節,為客(ke)戶提供一站式数據可視化分析與生物(wu)學意義挖掘服務。

截至(zhi)2024年6月20日,青莲百(bai)奥(ao)BioLadder云平臺使用人次突破100w啦!!!
BioLadder中包含的分析模块可以(yi)分為兩大(da)類(圖1):
實驗数據分析:针對蛋(dan)白質組學研究领域的實驗数據進行系(xi)統性分析工作,涵(han)盖原始實驗数據的處理、表達矩阵数(shu)據的統計分(fen)析等多個環節(圖1:C1-C3),為
常規数據分析是指不依(yi)赖於蛋白質組(zu)學實驗数據的分析方法,主要包括(kuo)基於已知蛋(dan)白質序列信息的分析、通用的分類(lei)算法應用以及功能(neng)预測分析等多個環節(详见圖1中的C4至C7部(bu)分)。
这些分析模块可以满足蛋白質(zhi)組學领域研究人員的大部分(fen)数據分析需求。

圖 1. BioLadder在蛋白質組数據分析框架中的模(mo)块(kuai)類別
在蛋白(bai)質組學研究领域的数據分(fen)析需求驅動下,BioLadder针對复雜的蛋白表達谱系統(tong)開发並推出了多種蛋白質組数據(ju)可視化
表1:每個新開发模块應用範畴

青莲百(bai)奥相信该公司開发的蛋白質組数據可視化模块能够满足蛋白質組學研究(jiu)在数據展示與分析方面的實际需求,為从事相關科研工作的(de)研究人員提(ti)供有价值的分析见解,帮(bang)助使用者在處理复雜的蛋(dan)白質組學
為(wei)了讓組學研究的用戶能(neng)够以最方便、最高效的方式使用我們的在線分析(xi)平臺(tai),BioLadder對各(ge)個環節進行了精心設計,包括輸入文件格式(圖2A)、參数設置(圖2B)、配(pei)色方(fang)案(圖2C),同時(shi)提供帮助文檔、微信客服和(he)實時工具提示,方便客(ke)戶访問(wen)相關帮助信息(圖2D)。

圖2 BioLadder 中的四種方便且人性化的設計
BioLadder為不同類型的数據提供了(le)轉(zhuan)换模块(例如,长格式(shi)和宽格式之間的轉(zhuan)换),並設計了一些模块直接支(zhi)持常见(jian)的蛋白質組學格式。此外,它還可以(yi)過滤掉(diao)某些最小定量值以下的数據,这(zhe)有助於(yu)消除可能由噪聲引起的結果。
為了满足蛋白質組學数據分(fen)析的特(te)定要求,BioLadder基於算法、数據预處理、数據展示過程中根據蛋白質組(zu)数據的(de)特點為一些模块建立了合適的默認參数,以盡可能减少參数調整的需求,同(tong)時為了满(man)足用戶偏好,BioLadder也選擇性(xing)的在(zai)部分個性化模块中加入了易於調整的參数,使用戶能够自定(ding)義(yi)他們的展示結果。
在科研数據可視化领域(yu)中(zhong),针對分析圖片有顏值追求的研究人員和(he)数據分析師來說(shuo),不(bu)当的顏色組合可能會顯著降低可視(shi)化的有效性,進而影響學術(shu)成(cheng)果的呈現質量。BioLadder作為一款專(zhuan)業的生物信息學(xue)可視化工具,融(rong)合了來自(zi)R包或ggplot2(https://github.com/tidyverse/ggplot2)的默認配色方案、Nature、Science和Lancet等國际(ji)權威文献或期刊中常用的優秀配色方案(an)(ggsci: https://github.com/nanxstats/ggsci),能够覆盖基因(yin)組學、蛋白質組學、代谢組學(xue)等多個研究方(fang)向的配色需求,满足各種用戶的差异化(hua)需求。
除以上人性化設計(ji)外,BioLadder還為使用者提供了部分额(e)外的支撐服務。
用戶(hu)指南模块為廣大用戶提供了多維度的服務支撐(cheng),涵(han)盖網站及功(gong)能概述、常见(jian)問題(ti)解答、各模块详細解析等(deng)内(nei)容,同時配備(bei)24H微信客服咨(zi)詢解答服務,帮助用(yong)戶快速了解平臺
工具提示模块為用戶提供了即(ji)時的參数(shu)設置帮助信息查阅能力,使用戶在配置各類參数(shu)時能(neng)够快速获取相關指导,从而確保參数的準
例:在熱圖(tu)模块中,提供了四種類型工具提示:
輸入文件详細信(xin)息(xi)的工具提示,包(bao)括文件内容解释、最大文件限製和文件(jian)格(ge)式;
下拉選擇框的工具提示,解(jie)释每個選項的含義(yi);
下载格式的(de)工具提(ti)示,提供下载(zai)說明和下载設置(zhi)的圖形解释;
在大多数模块的結果圖中的左上(shang)角,提供(gong)了一個"文本教程"鏈接(jie),以及解释圖表的工具提示,这些辅助性說明能够帮助用戶快(kuai)速理解圖表所展示内容的實(shi)际意義和重要性,从而更有效地解讀
这些工(gong)具提示使用戶能够轻松获(huo)取帮助信息,並无縫地繼續配置(zhi)和数據(ju)分析。
当前(qian)在線云平臺市場中存在的各類解決方案各具(ju)特色,BioLadder相比(bi)之(zhi)下展現了更為全面的功能覆盖,能够帮助用戶突破(po)傳統分析工具的局限(xian),真正實現"分析(xi)自由"这一核心訴求(qiu),讓研究人員在
表2 BioLadder與不同(tong)云平臺基於便利和個性(xing)化的設計比较

当然,除了以上展(zhan)示的(de)功能外
BioLadder云平臺還有更多便捷實用的分析模块等待大家親(qin)自探索
動動手指
點擊“BioLadder-生物信息在線分析可(ke)視化(hua)云平臺”
您(nin)也能成為生物信息分析專家